مدیرکل امور مالی و ذیحسابی

اداره کل امور اداری رفاه و پشتیبانی

دفتر برنامه بودجه و مطالعات اقتصادی

دفتر فناوری اطلاعات ارتباطات و تحول اداری

دفتر امور دارو و درمان

مرکز ملی تشخیص آزمایشگاه های مرجع و مطالعات کاربردی

دفتر مطالعات و ارزیابی مخاطرات غذا دارو و فرآورده های بیولوژیک

دفتر بهداشت و مدیریت بیماری های دام

دفتر بهداشت و مدیریت بیماریهای طیور زنبور عسل و کرم ابریشم

دفتر بهداشت و مدیریت بیماریهای آبزیان

دفتر نظارت بر بهداشت عمومی و مواد غذایی

دفتر قرنطینه و امنیت زیستی